轉基因生物從研發到應用要經歷漫長的過程，特別是轉基因農作物的研發。基于轉基因技術自身的特點，轉基因具有較大的非預期效應。近期發生在江蘇的轉基因棉花減產事件再次暴露了轉基因作物的弊病，長期安全性問題已經顯現。這些都清楚地表明當初轉基因作物的商業化決策過于草率，以及科學評估的不足；回顧轉基因作物應用的短短十余年，已經多次發生污染事件和田間種植失敗案例，轉基因作物并沒有給農民帶來長期的經濟效益和生計改善，也再次證實轉基因并不是未來農業發展的主要途徑。

同時，綠色和平的調查發現我國的轉基因水稻還面臨國外專利控制的風險。目前獲得轉基因生物安全證書的兩種轉基因水稻涉及多項國外專利，一旦進入商業化種植，我國糧食主權和安全都將面臨巨大的風險。

因此，綠色和平建議相關政府部門重新評估現有轉基因作物所涉及的知識產權情況，對轉基因糧食作物特別是轉基因水稻的商業化審批必須慎之又慎。進一步加大轉基因生物安全的評估，特別是轉基因作物對環境的長期安全性研究；同時，建議將更多資金投入到現代生態農業和分子標記輔助育種選擇技術這些已經被證實行之有效的技術和方法上，才能真正實現強農惠農以及我國農業的可持續發展。